YAYASAN HAKKA INDONESIA atau yang lebih dikenal dengan sebutan "HAKKA", didirikan pada tanggal 8 Agustus 1999. Pada tahun 2001, Yayasan membeli gedung yang sebelumnya dipergunakan untuk sekolah Madjapahit. Sesuai dengan kemajuan zaman dan untuk mengembangkan kebudayaan serta untuk memajukan pendidikan, Yayasan Hakka bertekad untuk mendirikan Sekolah Tiga Bahasa yang diberi nama "Sekolah Budi Agung".

Bulan Juli, tepatnya 15 Juli 2002 merupakan tahun pertama Sekolah Budi Agung menyelenggarakan pendidikan dengan menerima siswa tingkat TK, SD, SMP dan SMA dengan mendapat sambutan yang baik dari masyarakat. Di tahun pertama (TP 2002/2003) Sekolah Budi Agung mendapat murid sebanyak kurang lebih 300 siswa. Tahun 2003/2004 jum;ah murid menjadi kurang lebih 500 siswa. Tahun pelajaran 2004/2005 jumlah murid mencapai kurang lebih 700 siswa. Tahun 2006/2007 jumlah murid mencapai 1000 siswa. Memasuki tahun ke 10, Sekolah Budi Agung (TP 2012/2013) jumlah murid sudah mencapai 1.215 siswa. Dan pada tahun pelajaran 2015/2016 jumlah murid Sekolah Budi Agung sudah mencapai 1.350 siswa.

Pertambahan jumlah murid setiap tahun pelajaran membuktikan bahwa sekolah ini sudah berada pada arah yang tepat dan dapat menyesuaikan dengan kemajuan zaman.